Les caféiers d'Amérique en proie à la rouille

Le champignon Hemileia vastatrix provoque la plus grave maladie du caféier, la rouille du café. Elle donne une coloration caractéristique aux feuilles et empêche la photosynthèse de la plante. À partir de 1869, en l'espace de dix ans, ce parasite a complètement détruit les plantations du Sri Lanka, autrefois prospères. Depuis, le champignon prolifère surtout sur les plants d'arabica. Le robusta semble y être assez résistant. © Smartse, cc by sa 3.0 

Voilà plus d'un siècle que les producteurs de café se battent contre la rouille. Il s'agit d'une maladie qui atteint souvent les caféiers. Elle vient d'un champignon, Hemileia vastatrix, qui dévaste les plants. Si le problème a plus d'un siècle, l'Amérique centrale et l'Amérique du Sud font face à une des plus sévères épidémies jamais connues. Les champignons ont pris l'avantage sur les producteurs, et la récolte 2013-2014 ne sera pas bonne.

Le champignon a été observé pour la première fois en Amérique voilà une quarantaine d'années, mais les premières dévastations qu'il a provoquées datent de 1869. À Ceylan, au Sri Lanka, il a décimé 90 % des plants de café. Si bien que le pays a dû abandonner la production et favoriser les cultures de thé. En Amérique, la situation est si grave que les feuilles tombent. Les principaux pays ravagés sont le Nicaragua, le Salvador, le Mexique et le Costa Rica. Sur toutes les plantations, c'est 60 % des caféiers qui subissent des défoliations.

Le caféier d'Arabie peut atteindre neuf mètres de haut. Cet arbre est originaire d'Éthiopie, mais il a également été planté en Amérique centrale et en Amérique du Sud. Près de 85 % du café arabica est maintenant produit dans ces régions. Mais la récolte de 2013-2014 ne devrait pas être bonne, à cause de la rouille du café. © Fernando Rebelo, Wikimedia Commons, cc by sa 3.0 

Des membres de l'Institut du café du Costa Rica (Icafe) estiment que l'épidémie actuelle réduira de moitié la récolte de graines de café dans les régions les plus touchées. Le pays a donc adopté une loi d'urgence pour la lutte contre le champignon. D'autres pays l'ont rapidement rejoint dans la bataille. Le gouvernement nicaraguayen a même déclaré qu'il inclurait la rouille du café sur la liste des projets de recherche destinés à protéger l'agriculture du pays.

La rouille du café, un problème universel

Les chercheurs du Costa Rica séquencent actuellement le génome du champignon. Ils pourront ainsi croiser les plants de café avec des cellules souches résistantes. C'est peut-être en Colombie que l'on a observé les meilleurs résultats dans le métissage génétique. L'introduction de souches résistantes dans les caféiers a été couplée à une meilleure gestion de la météo et des fongicides. La prévention des épidémies de rouille a été nettement améliorée. Moins de 10 % des plantes doivent désormais être traitées avec un fongicide, ce qui représente 60 % de moins qu'il y a quatre ans.

Néanmoins, le problème est tellement répandu qu'il nécessite une collaboration internationale. Le chercheur brésilien Valdir Diola cherche à isoler les gènes de résistance dans le café. Il espère trouver les marqueurs moléculaires qui permettent de distinguer les différentes souches de l'agent pathogène. Harry Evans, au Royaume-Uni, travaille sur le génome de H. vastatrix. Enfin, Noah Phiri à Nairobi dépiste les plants de café résistants et analyse les variétés de l'agent pathogène. Le champignon n'est toutefois pas près d'être éradiqué, car il est répandu dans le monde entier. La seule solution radicale serait d'abandonner le café lui-même !