La cause est entendue : les agrocarburants, fabriqués par l'agriculture, conduiraient à un désastre écologique et alimentaire. On attend donc beaucoup des biocarburants dits de deuxième génération, réalisés à partir de débris végétaux. Un champignon dévoreur de vêtements pourrait peut-être nous y aider...
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L'histoire a paraît-il commencé durant la seconde guerre mondiale quand l'armée des Etats-Unis combattait dans le Pacifique sud un ennemi supplémentaire : Trichoderma reesei. Ce champignonchampignon microscopique était le coupable longtemps recherché de la destruction massive des tissus en coton, c'est-à-dire des vêtements, des tentes et des parachutesparachutes. Sa voracité témoigne d'une surprenante efficacité à transformer la cellulosecellulose (la matièrematière entourant les cellules végétales) en sucressucres simples, appelés monosaccharidesmonosaccharides, qui lui servent de nourriture. La première explication de cet appétit, supérieur à celui des espècesespèces voisines, est une production exceptionnellement élevée d'enzymesenzymes dégradant la cellulose.

Pour comprendre comment ce champignon atteignait un tel degré de performances, une équipe internationale, menée par Diego Martinez (Los Alamos National Laboratory), s'est intéressée à son génomegénome. Leurs résultats viennent d'être publiés dans Nature Biotechnology. La surprise est venue du faible nombre de types différents de gènesgènes impliqués dans la production d'enzymes digérant la cellulose (le génome complet de T. reesei ne contient d'ailleurs que 10.000 gènes). D'après les chercheurs, T. reesei possèderait des groupes de gènes similaires produisant en parallèle de grandes quantités d'enzymes.

Du carburant avec du bois, du foin ou des fumées d'usines

Ce champignon apparaît donc comme un bon candidat pour la production d'agrocarburants de deuxième génération, que l'on pourrait réaliser à partir de débris végétaux divers, comme des déchetsdéchets agricoles. T. reseei pourrait par exemple produire un cocktail enzymatiqueenzymatique qui, purifié, serait ajouté à une décoction de déchets organiques. Les sucres produits seraient alors facilement transformables en éthanol, c'est-à-dire en biocarburant utilisable dans un moteur à essence.

L'idée d'utiliser ce champion de la dégradation de la cellulose n'est d'ailleurs pas nouvelle puisque l'on en trouve la trace en 1994 dans la revue Enzyme and microbial technology (vol. 16, no 10, pp. 870-882), sous la plume de deux auteurs, Anjani Kumari et T. Panda, de l'Institut indien de technologie. En France, l'Inra (Institut national de la recherche agronomique) et le Cirad (Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement) cherchent également à se servir de ce champignon pour produire des carburants à partir de biomasse végétale. Ce programme, plus ambitieux, veut doter le champignon de gènes qui lui manquent : le petit trichoderme, en effet, ne sait pas digérer la ligninelignine, ce groupe de polymèrespolymères inventés par les végétaux et qui constituent le boisbois. Un champignon génétiquement modifié, qui aurait reçu des gènes d'autres espèces, pourrait donc efficacement, pensent ces chercheurs, valoriser le bois délaissé par l'exploitation forestière.

Ces recherches assez actives témoignent bien de l'intérêt pour une deuxième génération de biocarburantsbiocarburants, synthétisés à partir de matière végétale quelconque, voire de graisses animales. Mis au point dans les années 1920, le procédé Fischer-Tropschprocédé Fischer-Tropsch permet de produire assez facilement un hydrocarburehydrocarbure à partir de charboncharbon, de gazgaz mais aussi de matière organique. Dénommée BTL (biomass-to-liquid), cette voie pourrait donc valoriser les déchets végétaux de l'agriculture ou les copeaux de bois. Mais ce procédé souffre d'un rendement trop faible. Les ingénieurs ont commencé depuis longtemps à s'intéresser aux solutions inventées par les organismes vivants, qui semblent plus efficaces.

Aux Etats-Unis, la société Greenfuel propose déjà un réacteur utilisant des alguesalgues qui convertissent le gaz carboniquegaz carbonique ou des fumées d'usines en huile servant de carburant dans un moteur dieselmoteur diesel. A peine démarrée, la production d'agrocarburants à base de colza, de tournesoltournesol, de sojasoja, de betterave, de canne à sucre ou de céréalescéréales donne déjà des signes d'obsolescence, tant il apparaît impossible de subvenir aux besoins mondiaux en carburants. Les algues et les champignons semblent bien mieux placés...