Le superordinateur le plus puissant au monde a été mis au service de la recherche sur le SARS-CoV-2. Summit d'IBM a réussi à identifier 77 molécules potentiellement efficaces contre le coronavirus en seulement deux jours.
L'élaboration de traitements nécessite généralement plusieurs années. L'urgence de cette épidémie mondiale représente donc un véritable défi pour la communauté scientifique. Afin d'accélérer la recherche, IBM a mis le superordinateur Summit au service des chercheurs du laboratoire national d'Oak Ridge (ORNL) aux États-Unis. Les résultats publiés par Micholas Smith et Jeremy Smith, identifient 77 molécules potentiellement efficaces contre le virus SARS-CoV-2.
Les virus infectent les cellules hôtes en leur injectant un « pic », ou péplomère, de matériel génétique. Le but de la recherche est d'identifier des molécules capables de se lier à ces pics pour empêcher la propagation. Pour cela, les chercheurs en ont créé une modélisation en se basant sur les publications en date de janvier. Ils ont ainsi pu simuler l'effet de plus de 8.000 composés chimiques, en les classant dans l'ordre de ceux qui auraient la plus grande probabilité de se lier à la principale protéine « pic » du coronavirus.
Des années d’expériences simulées en deux jours
Summit est le supercalculateur le plus rapide au monde, équipé d'un « cerveau d'IA », spécifiquement conçu pour résoudre ce genre de problèmes. Il dispose d'une puissance de calcul de 200 pétaflops, soit 200 millions de milliards d'opérations à la seconde. Il a pu réaliser les simulations en deux jours, contre plusieurs années de travail en laboratoire.
Les chercheurs prévoient de nouvelles simulations en prenant en compte les dernières informations publiées sur la structure du coronavirus. Ces recherches serviront de point de départ pour des études expérimentales sur les différentes molécules afin d'identifier celles qui fourniront un traitement efficace contre le coronavirus.