La séquestration naturelle du CO2 est l'ensemble des mécanismes naturels qui conduisent à la fixation du CO2 de l’atmosphère ou de l'eau dans la biosphère et dans la lithosphère.
Il s'agit donc des puits de carbone continentaux et océaniques qui forment de la matière organique carbonée et des carbonates, au travers de réactions biochimiques (photosynthèse, biocalcification) ou chimiques (précipitation, complexation).
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