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La décarbonatation est l'élimination des carbonates du sol ou de l'eau, par des précipitationsprécipitations acides (dioxyde de carbonedioxyde de carbone, sol acide, pluie acide) ou par des procédés d'adoucissement de l'eau.

La décarbonatation peut aussi signifier l'élimination du CO2 d'une substance ou d'un matériaumatériau. Dans ce cas, ce terme est synonyme de décarbonisation.