En phylogénétique, un caractère autapomorphique est un caractère dérivé qui est propre à un taxon. Il n'est donc présent chez aucun autre taxon.
Ainsi, les autapomorphies permettent de déterminer des taxons, jusqu'à l'espèce.
Par exemple, au sein de Mollusques (embranchement Mollusca), le caractère de la coquille bivalve est une autapomorphie de la classe des Lamellibranches.
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