Après avoir dépassé ces planètes, les deux sondes ont suivi des trajectoires hyperboliques opposées et il est apparu qu'aux confins du Système SolaireSystème Solaire le signal doppler émis par les sondes différait de la valeur calculée selon le modèle standardmodèle standard. Les sondes Pioneer subissent une accélération non prévue orientée vers le SoleilSoleil : c'est ce qu'on appelle l'anomalieanomalie Pioneer.
Concrètement après plus de 30 années à voyager à travers le Système Solaire, les sondes sont 240.000 km plus proches du Soleil que le prévoit le profil de mission.
Aujourd'hui, il est très difficile d'expliquer l'origine de cette anomalie. Beaucoup d'hypothèses ont été suggérées, comme l'action thermique du plasmaplasma interplanétaire et du vent solairevent solaire en combinaison avec la matière noirematière noire et leur implication toujours possible sur la source d'énergieénergie nucléaire du vaisseau en une manifestation inconnue de la physiquephysique, voire une modification de la loi de la gravitationgravitation.
Les données de la mission qui ont été analysées par le passé n'ont pas permis d'apporter un semblant de réponse. Quelques scientifiques se sont intéressés à cette anomalie. Et en 2004, l'un d'entre eux a décidé de réanalyser toutes les données enregistrées par les missions Pioneer 10 et 11. Ce projet n'a pas été financé par la NASANASA mais par la Planetary Society. Cela a permis de restaurer les données enregistrées mais jamais exploitées par la NASA, en raison de restriction budgétaire.
L'analyse de ces dizaines d'années de données pourraient fournir de nouvelles informations afin de résoudre l'anomalie de Pioneer. Les scientifiques s'attendent à récupérer des informations concernant l'historique de la navigation des deux sondes, mais également des informations scientifiques des observations effectuées lors des survolssurvols de JupiterJupiter et SaturneSaturne.
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