La phylogenèse est l'histoire évolutive d'une espèce ou d'un groupe d'espèces apparentées.
L'étude de cette phylogénie recherche à déterminer les liens de parenté entre les groupes d'espèces de différents niveaux taxonomiques, de sorte à mieux comprendre leur évolution et à établir une classification des espèces en fonction de leur parenté.
Ce type de classification est donc dite « phylogénétique » et se présente souvent sous la forme d'un arbre dont le tronc constitue l'ancêtre commun de toutes les espèces figurées par les branches. Moins il y a de nœuds entre deux espèces, plus celles-ci sont proches en terme de parenté évolutive et de génétique.
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