Le nom « citrouille » vient du latin citrus, en allusion à la couleur orangée du fruit. Elle a probablement été domestiquée dans le nord du Mexique par les Amérindiens il y a 8 à 10.000 ans. Elle n'a été introduite en Europe qu'au XV-XVIe siècle où elle a remplacé une autre Cucurbitacée équivalente, d'origine asiatique.
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