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Les hyphes constituent l'appareil végétatif des champignonschampignons, tandis que la partie visible, celle que l'on appelle improprement champignon est en fait son appareil reproducteur.

Les hyphes sont des filaments plus moins ramifiés constitués d'une cellule unique qui peut mesurer plusieurs centimètres de long. Elles contiennent plusieurs noyaux et peuvent parfois être cloisonnées.