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Dans la classification des êtres vivants, un groupe ou taxontaxon est dit polyphylétique lorsque qu'il regroupe des taxons en excluant leur ancêtre communancêtre commun.

La polyphylie s'oppose ainsi à la monophyliemonophylie et la paraphylieparaphylie.

Sur le schéma ci-dessous, la sélection en rouge représente un groupe polyphylétique. Les taxons C à E ont un ancêtre commun mais il ne fait pas partie du groupe.