Un biofiltre a pour but de décontaminer un milieu, en filtrant les impuretés sources de pollution.
Les biofiltres sont couramment utilisés pour traiter les eaux polluées. Dans ce cas, l'eau est passée au travers d'un système constitué de microorganismes qui captent et décomposent les particules polluantes.
Des biofiltres permettant la dépollution de l'air sont aussi en développement (programme Phytair). Le système enverrait activement de l'air vers un mur végétal, choisi pour ses propriétés dépolluantes.
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