Le microbiote intestinal est un organe fascinant et la recherche est mobilisée afin de mieux comprendre les tenants et les aboutissants des micro-organismes qui colonisent notre intestin. Depuis vingt ans, de réelles découvertes et avancées ont été réalisées, slalomant entre les articles pseudo-scientifiques. Pour les vingt ans de Futura, je vous propose de parcourir les articles que nous avons publiés et qui font date concernant la recherche sur le microbiote. 


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    Ah ! le microbiotemicrobiote... Cet amas de micro-organismesmicro-organismes présent dans notre intestin et dans tous les recoins de notre organisme. Depuis quelques temps, tous les projecteursprojecteurs sont braqués sur lui, pas toujours pour les bonnes raisons. Si son identification est ancienne, l'engouement qu'il suscite grâce aux technologies de séquencage est récent. Dans cet article, voguons ensemble sur la planète des vraies découvertes de ces dernières décennies concernant le microbiote. 

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    Des découvertes fondamentales au niveau immunitaire

    Loin des slogans marketing qui souhaitent nous vendre des produits « renforçant notre immunitéimmunité », des expériences ont réellement mis en évidence les rôles fondamentaux du microbiote sur le bon fonctionnement de notre système immunitairesystème immunitaire. Par exemple, les hôtes que nous hébergeons remplissent nombre de fonctions métaboliques cruciales associées à notre immunité et qu'ils entraînent même certaines cellules immunitaires présentes dans d'autres sites de l'organisme, même si nous ne savons pas encore bien comment cela se déroule. 

    Le saviez-vous ?

    « Pourquoi ai-je choisi ce sujet ? Comme mentionné dans le titre, le microbiote est un domaine scientifique particulier. En cela, je veux dire qu'il est en pleine expansion au sein de la recherche scientifique moderne. Des nouvelles publications à son sujet sortent sans cesse, le domaine est fleurissant et extrêmement intéressant afin de mieux comprendre les services physiologiques majeurs que nous rendent les micro-organismes qui nous composent. La portée de ces recherches s'étend des fondamentaux, pour toujours mieux comprendre la physiologie du corps humain jusqu'au cadre clinique, où ces découvertes pourront, espérons-le, faire l'objet de quelques avancées thérapeutiques. D'un autre côté, le microbiote fait partie de la famille des sujets « panacée ». Les articles de vulgarisation ou de presse généraliste, souvent imprudents, le mettent en avant à toutes les sauces sans prendre le recul nécessaire pour en parler. C'est pourquoi il me semblait utile de réaliser cet article, afin de montrer que le microbiote est un sujet de recherche fascinant, prometteur et sérieux, et de rappeler à toutes les personnes qui seront amenées à en parler de rester sur leur garde. » Julien Hernandez

    Des explications en matière de prévention 

    Il est fréquent d'entendre que tel ou tel régime alimentaire prévient une maladie X ou Y. La piste du microbiote est intéressante pour expliquer ces corrélations, à supposer qu'elles ne soient pas fortuites. En 2020, des chercheurs ont démontré, dans un essai cliniqueessai clinique, que l'effet bénéfique du régime méditerranéen provenait en partie d'une modification au sein de la diversité des micro-organismes du microbiote.

    Les découvertes sur le microbiote naviguent entre les articles pseudo-scientifiques à son sujet. © DR, Fotolia
    Les découvertes sur le microbiote naviguent entre les articles pseudo-scientifiques à son sujet. © DR, Fotolia

    Une arme contre la covid-19 ? 

    Lors des pics de la pandémiepandémie de Covid-19Covid-19, les eaux uséeseaux usées ont été régulièrement analysées afin de déterminer la circulation du virus dans la population. Le SARS-CoV-2SARS-CoV-2 se promenait aisément au sein de nos voies digestives et a aussi, par conséquent, impacté notre microbiote. Des études préliminaires ont été réalisées mais il faudra attendre pour conclure, étant donné le caractère observationnel et récent de ces études. 

    Des liens avec les maladies 

    Sujet houleux s'il en est, nous lisons tout et son contraire à ce sujet. Et ceci pour la raison suivante : les liens entre microbiote et maladies sont extrêmement complexes. Il joue sûrement un rôle dans la dépression ou encore dans l'obésité. Actuellement, des chercheurs travaillent d'arrache-pied afin de comprendre plus finement les mécanismes qui relient microbiote et maladies, et trier les corrélations fortuites, des causalités réelles

    L'épidémiologie pour les nuls ! 

    Séquencer le microbiote intestinal est devenu plus facile mais cela demande toujours du temps et du matériel de pointe à disposition. Très récemment, des chercheurs se sont servis d'un protocoleprotocole sommaire pour que tout le monde puisse, chez soi, connaître avec précision son temps de digestion et en induire la composition précise de son microbiote.

    Le microbiote n'a pas encore révélé tous ses secrets © picture-waterfall, Adobe Stock
    Le microbiote n'a pas encore révélé tous ses secrets © picture-waterfall, Adobe Stock

    Une applications clinique importante

    C'est la seule application clinique qui ait fait ses preuves jusqu'à présent : la transplantation fécale dans le cadre d'une infection résistancerésistance à Clostridioes difficile. Depuis, d'autres applications cliniques sont recherchées pour lesquelles cette technique pourrait servir. Des cas cliniques ont été décrits dans certaines maladies neurodégénérativesmaladies neurodégénératives, mais des essais cliniques sérieux doivent encore être conduits. 

    Un acteur majeur de la digestion et des fonctions métaboliques

    Plusieurs études ont pu mettre en évidence le rôle essentiel du microbiote en matière de digestion, par exemple dans l'absortion du fer et également celui de ces fonctions métaboliques au niveau cardiovasculaire et glycémique. Il a aussi été démontré qu'il pouvait interférer avec des médicaments ou au contraire potentialiser leur action.

    Un microbiote en mouvement

    Comme toute chose qui concerne le vivant, le microbiote est loin d'être fixe et inerte. Il évolue et s'adapte même à notre consommation alimentaire, par exemple chez les personnes intolérantes au lactoselactose, où il se modifierait pour rendre la digestion du sucre provenant du lait plus facile. Des recherches sont également menées concernant le microbiote de nos ancêtres, un champ de recherche qui pourra sans aucun doute nous aider à mieux comprendre l'évolution de l'humanité. 

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