Un allèle est hypomorphe lorsque le produit du gène a la même fonction que le gène sauvage, mais qu'il est moins exprimé ou qu'il donne lieu à un produit moins actif. Un allèle hypomorphe ne doit pas être confondu avec un allèle amorphe (ou nul), pour lequel la mutation abolit la fonction du produit du gène.
Ces deux types d'allèles consistent en une perte ou une diminution d'une fonction. Ils sont en général récessifs par rapport à l'allèle sauvage, ce qui signifie que leur effet est visible uniquement si l'organisme porte les deux copies de ces allèles.
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