<p><em>Teloschistes chrysophthalmus</em>, lichen fruticuleux. Il est&nbsp;tr&egrave;s sensible &agrave; la pollution atmosph&eacute;rique. C'est une [popupdefinition id=2261]esp&egrave;ce[/popupdefinition] tr&egrave;s spectaculaire qui pousse uniquement sur les [popupdefinition id=14137]arbres[/popupdefinition] face au [popupdefinition id=3727]soleil[/popupdefinition].&nbsp;Les lobes pr&eacute;sentent de nombreuses [popupdefinition id=976]fibrilles[/popupdefinition] marginales.&nbsp;Ses apoth&eacute;cies orange, qui sont tr&egrave;s fr&eacute;quentes, mesurent 2 &agrave; 7 mm, elles sont bord&eacute;es de [popupdefinition id=3156]cils[/popupdefinition] clairs. Photo prise dans l'H&eacute;rault, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

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Lichen fruticuleux

Yannick Agnan est né en 1985 dans la région parisienne. En 2003, il obtient son baccalauréat Scientifique, et débute des études de Biologie/Géologie à l’université de Toulouse. Après un bref passage à l’IUFM pour concourir au CAPES de SVT, il débute un master de Géosciences de l’environnement. À l’issue de cette formation, il entreprend une thèse en Biogéochimie de l’environnement au Laboratoire écologie fonctionnelle et environnement (EcoLab) soutenue en 2013. 

Sa thématique de recherche porte alors sur l’évaluation de la pollution atmosphérique en métaux et en azote dans les grands massifs forestiers français à travers des outils géochimiques appliqués à la biosurveillance par les lichens. Il met également en parallèle deux approches de biosurveillance (bioaccumulation et bioindication) pour évaluer la sensibilité des différentes espèces de lichens face à la pollution métallique. 
Après sa thèse, il débute une mission de biosurveillance par les lichens au sein de l’Institut écocitoyen pour la connaissance des pollutions (IECP), association visant à évaluer les impacts environnementaux et sanitaires de la zone industrialo-portuaire de Fos-sur-Mer. En juillet 2014, il entame un post-doctorat au Desert Research Institute (DRI) de l’Université de Reno (Nevada, États-Unis) dans le département de Chimie atmosphérique. Sa recherche vise à mieux comprendre la dynamique du mercure en milieu polaire (Alaska), et principalement à l’interface sol-glace-atmosphère.

Site personnel : Sciences et environnement.

Yannick Agnan 

Etoile centrale du système solaire. 
Le Soleil est l'étoile la plus proche de la Terre, dont elle est distante d'environ 150 millions de kilomètres. Le Soleil est situé à 8,5 kparsecs du centre de la Voie lactée. Dans la classification des étoiles, le soleil est une étoile de type G2.
La masse du Soleil représente la majeure partie de la masse du système solaire. Elle est utilisée comme unité de masse pour les étoiles. L'énergie solaire, d'une importance capitale pour la Terre et notamment pour la vie, est produite par les réactions nucléaires qui se déroulent au coeur du Soleil. Agé d'environ 5 milliards d'années, le Soleil continuera à briller, avec une luminosité augmentant lentement, pendant une durée équivalente, avant d'évoluer en géante rouge et finalement de mourir.
Le mouvement apparent du Soleil par rapport à la Terre donne lieu aux saisons, dues à l'inclinaison du plan de l'écliptique par rapport à celui de l'équateur terrestre. 
La rotation de 27 jours du Soleil autour de lui-même a été découverte par Galilée en 1611. 
On distingue dans le Soleil diverses couches parmi lesquelles le noyau ou coeur, la zone radiative, la zone de convection, la photosphère (qui émet la majeure partie de la lumière solaire), la chromosphère et sa partie extérieure, la couronne. La densité décroît avec l'altitude, du noyau vers l'atmosphère. La température régnant dans le noyau est de l'ordre de 15 millions de kelvins. Elle décroît dans les zones radiatives et convectives. Dans la photosphère, qui constitue la surface visible du Soleil, elle est de l'ordre de 5800 K en moyenne. Dans les plus basses couches de la chromosphère, la température décroît avec l'altitude jusqu'à environ 4500 K, avant de croître à nouveau, surtout dans la zone de transition, où cette croissance est très forte sur une épaisseur réduite. La température de la couronne atteint des températures de l'ordre de 106 K. Cette température extrêmement élevée n'est pas encore totalement expliquée. 
L'atmosphère solaire est un milieu complexe constitué de plasma soumis à un champ magnétique intense, siège d'éruptions solaires et qui émet le vent solaire. Les taches solaires, qui apparaissent sombres à cause de leur température plus basse sont, comme la couronne, des radiosources. L'activité solaire liée à ces phénomènes varie de manière cyclique.
Récemment, l'héliosismologie a permis de mieux appréhender la structure interne du Soleil. La couche convective interne n'est connue que par les ondes étudiées dans cette discipline et par l'étude des neutrinos solaires, produits au cours des réactions nucléaires se déroulant dans le coeur. Le déficit des neutrinos solaires observés par rapport à ceux attendus est l'une des interrogations de l'astrophysique solaire. 
L'observation du spectre solaire s'effectue grâce à des spectrohéliographes. Ce spectre comprend des raies, connues depuis Fraunhofer (1814), qui signalent la présence d'hydrogène et d'hélium principalement et d'une soixantaine d'autres éléments. Il comprend également des bandes qui trahissent la présence de molécules dans l'atmosphère solaire.

Soleil

Projection sur le disque du Soleil de la partie supérieure de spicules.

Fibrille

Les cils sont de minuscules poils, que l'on trouve par exemple sur le bord des paupières, dans les trompes de Fallope, ou dans la muqueuse nasale. Leur rôle et de filtrer les particules ou de faire circuler des substances le long du revêtement muqueux, grâce à leurs mouvements vibratoires.

Cils

Chez les espèces eucaryotes : Groupe d'êtres vivants pouvant se reproduire entre eux (interfécondité) et dont la descendance est fertile.L'espèce est l'entité fondamentale des classifications, qui réunit les êtres vivants présentant un ensemble de caractéristiques morphologiques, anatomiques, physiologiques, biochimiques et génétiques, communes.Espèce, un ensemble d'individusLes espèces sont regroupées en genres et divisées en sous-ensembles dénommés variétés, races, souches ou populations. Le recensement des espèces et de leur biodiversité relève de la systématique, leur nomenclature de la taxinomie.Chez les procaryotes, il n'y a pas de notion d'inter fécondité, et l'espèce n'est pas définie de cette manière mais à partir de critères d'identité ou de proximité des génomes ou de certaines séquences d'ADN.

Espèce

En biologie, un arbre peut désigner un végétal ou une représentation schématique d’une classification.L’arbre, végétal lignifiéUn arbre est un végétal supérieur terrestre, qu’il soit gymnosperme ou angiosperme, qui se rigidifie grâce à une croissance secondaire (celle qui produit du bois). Cette lignification lui permet ainsi de grandir en hauteur, au-delà de sept mètres, en étant soutenu par un tronc.Grâce à leur hauteur et à leur forte occupation spatiale, notamment à la suite de la présence de branches persistantes portant des feuilles, les arbres possèdent de grandes surfaces d’échange pour la photosynthèse. Précisons encore que ce sont des organismes pérennes, ce qui signifie qu’ils peuvent vivre des années, des décennies, des centenaires, voire des millénaires.Les arbres, qu’ils soient isolés ou rassemblés en forêt, jouent un rôle écologique majeur. Grâce à la photosynthèse, ils fixent du carbone atmosphérique. Par ailleurs, ils participent activement au cycle de l’eau, au travers de l’évapotranspiration. Enfin, ils constituent des écosystèmes complexes et servent de refuges de biodiversité.L’arbre en phylogénie et en généalogieDes arbres sont utilisés en généalogie et en phylogénie pour représenter schématiquement des filiations entre personnes ou taxons à partir d’un ancêtre commun.Quels arbres poussent le plus vite ?Pour qu'un arbre se développe du mieux que possible, une règle importante à suivre est de lui trouver un emplacement dans un environnement qui lui convient en fonction de son besoin en ensoleillement et du type de sol. L'entretien a également son importance, par exemple certains arbres ont besoin d'être taillé régulièrement et le besoin en eau peut varier. Il faut savoir que certains arbres poussent plus vite que d'autres ce qui peut être avantageux pour aménager son jardin : le tilleul, le mimosa, le laurier rose, le magnolia, la Palma trachycarpus fortunei, le cerisier japonais, l’eucalyptus gunnii...

Arbre

7525_lichen-fruticuleux

<p>Coupe transversale d'une apoth&eacute;cie de <em>Xanthoria parietina </em>ou lichen encro&ucirc;tant&nbsp;&nbsp;(observation au [popupdefinition id=7783]microscope &eacute;lectronique &agrave; balayage[/popupdefinition]). Il est de [popupdefinition id=4126]couleur[/popupdefinition]&nbsp;jaune vif. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

Xanthoria parietina

La couleur, c'est ce qui permet de différencier deux objets de formes et de structures identiques, par exemple le drapeau italien du drapeau français. C'est aussi ce qui n'est ni blanc, ni gris, ni noir. Le blanc et le noir étant les bornes de la gamme des gris neutres.
Quelquefois, la couleur est utilisée pour désigner un objet, comme dans le cas d’un tube de rouge pour parler du rouge à lèvres, par exemple. La couleur est aussi parfois confondue avec la tonalité. Par exemple dans un ton vert, il y a plusieurs couleurs vertes, plus ou moins claires ou foncées. Une couleur est unique.
Il existe deux systèmes trichromatiques (trois couleurs primaires) :
par synthèse additive, dont les couleurs primaires sont rouge, vert et bleu (RVB) ;et par synthèse soustractive, dont les couleurs primaires sont cyan, magenta et jaune (CMJ).
La couleur du physicien
La couleur, c’est aussi la sensation produite par un rayonnement physiquement défini appelé stimulus. Celui-ci pénètre dans l'œil et est capté par des millions de cônes répartis dans la rétine mais surtout concentrés dans sa partie centrale, la fovéa, siège de la vision la plus distincte.
Pour le physicien, le terme de couleur renvoie donc à la couleur spectrale, c’est-à-dire à la perception sensorielle de l’œil humain en fonction de la longueur d’onde de la lumière qu’il reçoit. Ainsi, une lumière de longueur d’onde 550 nm est perçue comme étant de couleur verte. Le spectre visible est composé des sept couleurs de l’arc-en-ciel, soit rouge, orange, jaune, vert, bleu, indigo et violet. Le vert étant la couleur à laquelle l’œil humain est le plus sensible.
 L’œil humain peut différencier près de huit millions de nuances de couleurs. Pourtant, cet organe si avancé ne donne que peu d’informations à notre cortex pour créer une image. Alors que se passe-t-il exactement lorsque nous voyons ? Unisciel et l’université de Lille 1 nous expliquent, avec le programme Kézako, le fonctionnement de ce surprenant organe. © Unisciel
La production des couleurs
C’est en interagissant (absorption, diffusion, réfraction, interférences ou diffraction) avec la matière que la lumière produit des couleurs. La couleur bleue du ciel est ainsi le résultat d'une combinaison de plusieurs de ces phénomènes.
L’absorption de lumière est l’un des principaux mécanismes qui entrent dans le jeu des couleurs dans la vie courante. En effet, la plupart des matériaux ont pour particularité d’absorber certaines longueurs d’ondes de la lumière. Si, par exemple, les carottes nous apparaissent orange, c’est qu’elles contiennent du bêtacarotène qui absorbe les longueurs d’ondes comprises entre le violet et le vert et réfléchit la partie du spectre allant du rouge au vert.
La couleur du physicien des particules
Le physicien des particules utilise le terme « couleur » pour désigner un nombre quantique attribué aux quarks et aux gluons. Ainsi, les quarks existent en trois couleurs : rouge, bleu et vert. Les hadrons, quant à eux, sont de couleur neutre, c’est-à-dire blancs. Cependant, aucun rapport ici avec une perception visuelle que nous pourrions en avoir.
La notion de charge de couleur a été introduite pour expliquer la coexistence des quarks au sein des hadrons, tout en satisfaisant le principe d’exclusion de Pauli. Aujourd’hui, la chromodynamique quantique joue un rôle important dans le modèle standard de la physique des particules.

Couleur

Le microscope électronique à balayage est un microscope électronique qui permet de visualiser des objets en relief.
Technique du microscope électronique à balayage
Le microscope électronique à balayage (MEB ou SEM en anglais pour scanning electron microscopy) utilise un fin faisceau d’électrons, émis par un canon à électrons. Des lentilles électromagnétiques permettent de focaliser le faisceau d’électrons sur l’échantillon.
L’interaction entre les électrons et l’échantillon provoque la formation d’électrons secondaires de plus faible énergie. Ils sont amplifiés puis détectés et convertis en un signal électrique. Ce processus est réalisé en chaque point de l’échantillon par un balayage du microscope. L’ensemble des signaux permet de reconstruire la typographie de l’échantillon et de fournir une image en relief.
La préparation des échantillons est contraignante. Ils doivent être déshydratés puis subir un traitement pour devenir conducteur (fixation des tissus, nettoyage). L’échantillon est ensuite placé sur le porte-objet.
Utilisation du microscope électronique à balayage
Grâce au microscope électronique à balayage, il est possible de voir la surface d’objets, de bactéries, de matériaux… La grande profondeur de champ est un atout de ce microscope. La résolution (1 nanomètre) est en revanche moins bonne que celle du microscope électronique en transmission (0,1 nanomètre).Champ lexical : mEB | sEM

Microscope électronique à balayage

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<p>Coupe transversale d'un thalle de <em>Xanthoria parietina</em> (observation au [popupdefinition id=7783]microscope &eacute;lectronique &agrave; balayage[/popupdefinition]). &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

Coupe transversale d'un thalle - Photos Futura

Yannick Agnan est né en 1985 dans la région parisienne. En 2003, il obtient son baccalauréat Scientifique, et débute des études de Biologie/Géologie à l’université de Toulouse. Après un bref passage à...

Le microscope électronique à balayage est un microscope électronique qui permet de visualiser des objets en relief.
Technique du microscope électronique à balayage
Le microscope électronique à balayag...

Coupe transversale d'un thalle

7523_coupe-transversale-d-un-thalle

<p><em>Cladonia coniocraea,</em> lichen complexe constitu&eacute; de thalles primaires en &eacute;caille&nbsp;d'environ 5 mm et de thalles secondaires faisant penser &agrave; des cornes dress&eacute;es et courb&eacute;es de 1 &agrave; 3 cm de hauteur,&nbsp;effil&eacute;es vers le sommet. Il&nbsp;se d&eacute;veloppe&nbsp;sur des&nbsp;&eacute;corces ou du&nbsp;[popupdefinition id=4042]bois[/popupdefinition]. Photo prise dans le&nbsp;Tarn, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

Lichen complexe

Nom masculin : tissu complexe formé de cellules disposées longitudinalement (cellules conductrices, fibres) et transversalement (rayons). Le bois constitue la plus grande partie du tronc des plantes ligneuses.

Bois

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<p><em>Usnea florida </em>est un&nbsp;lichen fruticuleux aux apoth&eacute;cies (organes de reproduction sexu&eacute;e) pourvues de [popupdefinition id=976]fibrilles[/popupdefinition]. C'est un lichen corticole que l'on trouve sur les ch&ecirc;nes et les [popupdefinition id=2272]feuillus[/popupdefinition]. Photo prise &agrave;&nbsp;Bex, Suisse. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s.</p>

Usnea florida

Les feuillus sont des arbres à feuilles caduques (qui perdent leurs feuilles en hiver). Le Buis, le Chêne vert, le Houx, le Laurier…, aux feuilles persistantes, font aussi partie des feuillus.

Feuillus

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<p><em>Evernia prunastri</em> est un&nbsp; lichen fruticuleux parfois sor&eacute;di&eacute;. Les sor&eacute;dies sont de&nbsp;petites [popupdefinition id=11542]boutures[/popupdefinition] naturelles mixtes qui assurent la reproduction du lichen.&nbsp;Son appareil v&eacute;g&eacute;tatif appel&eacute; thalle est constitu&eacute; de lani&egrave;res aplaties formant une sorte de petit buisson qui pend. Il est g&eacute;n&eacute;ralement gris vert, et gris blanc. Photo prise dans le&nbsp;Tarn, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

Evernia prunastri

Une bouture correspond à un morceau de végétal qui a été détaché d’une plante mère puis replanté dans un milieu propice. Il peut alors redonner naissance à une nouvelle plante grâce à l’apparition de racines ou d’organes aériens. Il s’agit d’une multiplication végétative. La nouvelle plante est un clone de la mère, elle a le même patrimoine génétique. 
Principe de la bouture
Le bouturage existe grâce à une propriété propre aux végétaux. Certaines cellules peuvent se dédifférencier pour redonner naissance à des cellules méristématiques (qui peuvent se diviser). Celles-ci se multiplient alors pour reformer un nouveau méristème dont l’activité permet de reconstruire les organes manquants. 
Certaines espèces végétales, telles que Kalanchoë pinnata, pratiquent naturellement le bouturage puis se reproduire végétativement. Cependant, ce mode de reproduction est bien souvent pratiqué artificiellement par l’Homme (amateur ou professionnel).

Bouture

7527_evernia-prunastri

<div><em>Xanthoparmelia conspersa </em>est un&nbsp;&nbsp;lichen foliac&eacute; caract&eacute;ristique des roches [popupdefinition id=2480]basaltiques[/popupdefinition].&nbsp;Photo prise dans l'H&eacute;rault&nbsp;France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</div>

Lichen foliacé

Le terme « basaltique » se réfère à toute formation minérale étant composée majoritairement de basalte ou ayant la composition du basalte. On parle par exemple de coulées basaltiques, d’épanchement basaltiques, de plateaux basaltiques, d’orgues basaltiques…Du matériel d’origine volcaniqueCe terme sous-entend une origine volcanique, car le basalte est une roche formée par le refroidissement rapide de laves de composition basique. Les basaltes sont composés de 50 % de plagioclases, de 25 à 40 % de pyroxènes, de 10 à 25 % d’olivine et d’un faible pourcentage de magnétite. Ces minéraux donnent une couleur plutôt sombre à tout matériel basaltique. La texture est généralement fine, avec des cristaux très petits (aspect microgrenu). Les matériaux basaltiques sont donc généralement caractérisés par une pâte sombre dans laquelle quelques petits cristaux peuvent être identifiés. Ils peuvent également contenir des petites cavités qui sont les bulles de gaz piégées lors du refroidissement.Basalte. © Max.kit, Wikimedia Commons, CC by-sa 4.0Les magmas basaltiques sont issus de la fusion partielle d’un manteau de composition lherzolitique (manteau primitif). Actuellement, les grandes régions basaltiques se situent au niveau des trapps de Sibérie et du Deccan, ainsi que du plateau de la Columbia aux États-Unis. Les épanchements basaltiques caractérisent également le volcanisme ayant lieu au niveau des dorsales océaniques : le basalte forme ainsi la couche superficielle de la croûte océanique et en est donc l’un des composants essentiels.Les volcans d’Auvergne peuvent-ils se réveiller ?Les volcans islandais, qui se situent au niveau de la dorsale médio-Atlantique, produisent de grandes quantités de laves basaltiques. En France, certains volcans du Massif Central ont également généré des coulées basaltiques.Formes variées et distribution dans le Système solaireCes roches se retrouvent également sur d’autres planètes, comme la Lune ou Mars, mais également Mercure et Vénus où de grands systèmes volcaniques ont été identifiés. Les fameuses « mers » lunaires, étendues sombres visibles à l’œil nu depuis la terre, sont en réalité de grandes étendues de matériel basaltique.Les matériaux basaltiques peuvent avoir des formes très variées, qui dépendent principalement des conditions de refroidissement de la lave. Au fond des océans, on trouve ainsi souvent des basaltes dits en coussin (pillow-basalts), qui refroidissent très rapidement au contact de l’eau de mer froide.Basaltes en coussin © NOAA, domaine publicLes orgues basaltiques, impressionnantes formations de colonnes de basalte à coupe hexagonale, résultent, quant à eux, d’un refroidissement par contraction thermique à cause d’une différence de vitesse de refroidissement entre la surface de la coulée et sa base.Orgues basaltiques, La Gomera, Canaries. © Rainer Haessner, Wikimedia Commons, CC by-sa3.0

Basaltique

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<div><em>Lobaria virens</em> est un&nbsp;lichen foliac&eacute; de grande taille caract&eacute;ristique des milieux ombrag&eacute;s. Photo prise dans le&nbsp;Finist&egrave;re, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</div>

Lobaria virens

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<div><em>Pleurosticta acetabulum </em>est un&nbsp;lichen foliac&eacute; &agrave; grandes apoth&eacute;cies. Il est&nbsp;corticole et prosp&egrave;re&nbsp;sur le tronc des&nbsp;[popupdefinition id=2272]feuillus[/popupdefinition],&nbsp;[popupdefinition id=14137]arbres[/popupdefinition] isol&eacute;s, les&nbsp;vergers, p&acirc;tures. Il est&nbsp;commun jusqu'&agrave; l'&eacute;tage montagnard.&nbsp;Photo prise dans les&nbsp;Bouches-du-Rh&ocirc;ne, France.&nbsp;&copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s&nbsp;</div><p>&nbsp;</p>

Pleurosticta acetabulum

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<p><em>Parmelia tiliacea </em>est un&nbsp;lichen foliac&eacute; fortement isidi&eacute;. C'est un lichen&nbsp;coriace, assez &eacute;pais.&nbsp;Les extr&eacute;mit&eacute;s ont des&nbsp;lobes arrondis, mais entaill&eacute;s. Le dessous est brun fonc&eacute;, mais devient plus lumineux vers le bord.&nbsp;Photo prise dans les&nbsp;Bouches-du-Rh&ocirc;ne, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</p>

Parmelia tiliacea

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<div><em>Physcia biziana </em>est &nbsp;un&nbsp;&nbsp;lichen foliac&eacute; &nbsp;tr&egrave;s&nbsp;caract&eacute;ristique du milieu littoral m&eacute;diterran&eacute;en.&nbsp;Thalle en [popupdefinition id=5330]rosette[/popupdefinition] de 2 &agrave; 7 cm de diam&egrave;tre, bien appliqu&eacute; sur le [popupdefinition id=816]substrat[/popupdefinition], d&eacute;pourvu de soralie, d'isidie et de [popupdefinition id=976]fibrille[/popupdefinition] sur le bord des lobes. Absence de points blancs (pseudocyphelles) sur la face sup&eacute;rieure du thalle. Photo prise dans les&nbsp;Bouches-du-Rh&ocirc;ne,&nbsp;France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</div>

Physcia biziana

Structure observée à la surface de certaines cellules, épithéliales notamment.
Elle prend la forme d'une invagination à l'intérieur de laquelle se trouvent des allongements en forme de doigts. Chacune de ces protubérance est constituée d'un cœur d'actine entouré d'un certain nombre de protéines formant un anneau. A cause de leur forme, ces structures ont d'abord été appelées rosettes.
Elles semblent associées à des processus invasifs de cellules tumorales, et plus précisément impliquées dans la destruction de matrices extracellulaires, les membranes basales. De là vient leur appellation d'invadopodes.
D'autres structures, ne différant que par des détails d'architecture, ont été observées sur d'autres types cellulaires, et sont appelées des podosomes. La distinction entre ces deux types de structures est encore floue.

Invadopode

Le terme substrat s'emploie dans deux domaines : en biologie mais surtout en botanique.Qu'est-ce que le substrat en botanique ?En horticulture, support ou base sur lequel peuvent se développer les végétaux. Ce peut être aussi bien des sédiments, de la vase, des roches… que des granulats spécifiques à un bassin biologique. Il peut ainsi s'agir de divers types de sols, de roches, de substrats artificiels ou de tout autre milieu dans lequel les plantes peuvent enraciner et se développer. Le substrat joue un rôle crucial dans la santé et la croissance des plantes, car il fournit les éléments nutritifs, l'eau et l'oxygène nécessaires à leur survie. Le choix du substrat approprié dépend souvent des besoins spécifiques de la plante, du milieu de culture et des conditions environnementales.Composition du substratLa composition du substrat peut inclure des éléments organiques, minéraux et des matériaux d'origine végétale ou animale. Voici quelques exemples de composants couramment présents dans les substrats botaniques :Matériaux organiques :Humus : matière organique décomposée provenant de la décomposition de la matière végétale.Compost : mélange organique résultant de la décomposition contrôlée de matières végétales et animales.Tourbe : matière organique partiellement décomposée issue des tourbières.Matériaux inorganiques :Sable : matériau granulaire d'origine minérale utilisé pour améliorer le drainage du substrat.Perlite : matériau siliceux expansé utilisé pour améliorer l'aération et le drainage du substrat.Vermiculite : minéral expansé utilisé pour améliorer la rétention d'eau du substrat.Quelle est la différence entre substrat et terreau ?Le substrat et le terreau sont deux termes couramment utilisés en jardinage et en horticulture, bien qu'ils puissent parfois être utilisés de manière interchangeable, ils font référence à des concepts légèrement différents :Substrat : en botanique, le substrat est un terme général qui désigne le matériau ou le support sur lequel les plantes poussent. Cela peut inclure différents types de sols, de mélanges de terre, de roches, de substrats artificiels ou de tout autre milieu dans lequel les racines des plantes peuvent se développer et se nourrir.Terreau : le terme "terreau" est spécifique à un mélange de substances organiques et inorganiques qui est spécialement préparé pour être utilisé comme milieu de culture pour les plantes en pot ou en jardinage. Il est généralement composé de tourbe, de compost, de vermiculite, de perlite et d'autres matières organiques ou minérales qui favorisent la croissance des plantes en fournissant des nutriments, une bonne aération, un drainage adéquat et une rétention d'eau appropriée.

Substrat

7532_physcia-biziana

<div><em>Candelaria concolor </em>est&nbsp;&nbsp;l'une des plus petites [popupdefinition id=2261]esp&egrave;ces[/popupdefinition] de lichens foliac&eacute;s. Lorsqu'il est jeune, il ressemble &agrave; de la [popupdefinition id=5908]mousse[/popupdefinition] dense et courte et peut recouvrir de grandes &eacute;tendues.&nbsp;Photo prise dans les&nbsp;Bouches-du-Rh&ocirc;ne, France. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</div><p>&nbsp;</p>

Candelaria concolor

Les bryophytes, groupe diversifié de plantes non vasculaires, représentent l'une des premières étapes de l'évolution végétale sur terre. Composées de mousses, d'hépatiques et anthocérotes, ces plantes primitives ont prospéré dans une variété d'habitats, des régions humides aux environnements arctiques, contribuant à la formation des sols et jouant un rôle essentiel dans les cycles biogéochimiques. Cet article explore en détail la définition, la diversité et l'importance écologique des bryophytes.Diversité des bryophytesLes bryophytes comprennent trois groupes principaux : les mousses (Bryophyta), les hépatiques (Hepatophyta) et les anthocérotes (Anthocerotophyta). Ces plantes partagent certaines caractéristiques communes, notamment l'absence de vaisseaux conducteurs de sève, la reproduction via des spores et une alternance de générations entre une phase gamétophytique dominante et une phase sporophytique réduite.Les mousses, souvent trouvées dans des environnements humides, forment des tapis verts caractéristiques. Les hépatiques, quant à elles, se présentent sous une variété de formes, certaines ressemblant à des feuilles plates, tandis que d'autres ont une apparence plus complexe. Les anthocérotes, moins connues, se distinguent par la forme de leurs thalles en forme de cornes.Les bryophytes, comme les mousses, sont des plantes non vasculaires, plutôt petites et qui poussent dans des habitats humides. © ArtushFoto, Adobe StockCycle de vie et reproductionLe cycle de vie des bryophytes est caractérisé par une alternance de générations entre le gamétophyte, produisant des gamètes, et le sporophyte, produisant des spores. La phase gamétophytique, généralement dominante, se présente sous la forme d'un thalle vert et aplati chez les mousses et les hépatiques. Les anthocérotes ont une structure thalloïde semblable mais avec des thalles plus simples.La reproduction des bryophytes se fait généralement par la libération de spores à partir du sporophyte. Ces spores se dispersent dans l'environnement, germent, et donnent naissance à de nouveaux gamétophytes, fermant ainsi le cycle de vie. Les bryophytes se développent sur de nombreux supports : sur le sol, sur des troncs d’arbres, du bois mort, des rochers...Bloc "Le saviez-vous ?"Importance écologique des bryophytesBien que souvent négligées en raison de leur taille modeste, les bryophytes jouent un rôle crucial dans les écosystèmes terrestres. Leurs tapis denses contribuent à la stabilisation des sols, prévenant l'érosion et facilitant la colonisation d'autres plantes. En absorbant l'eau et en contribuant à la formation de litière, les bryophytes créent des microclimats favorables à d'autres organismes.Les mousses sont également capables de fixer l'azote atmosphérique, enrichissant ainsi les sols en nutriments. En tant qu'indicateurs environnementaux sensibles, les bryophytes peuvent également être utilisées pour évaluer la qualité écologique des habitats, reflétant les changements dans les niveaux d'humidité, d'acidité et de pollution atmosphérique.Champ lexical : plante non vasculaire | mousse

Bryophyte

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<div><em>Physcia adscendens</em> est un lichen foliac&eacute; qui colonise tout type de milieux : &eacute;corce des troncs,&nbsp;des branches, sur le&nbsp;[popupdefinition id=4696]ciment[/popupdefinition].&nbsp;Il&nbsp;r&eacute;siste assez bien &agrave; la pollution. On peut le voir &eacute;galement sur les aiguilles d'un conif&egrave;re comme la photo jointe prise dans le Tarn, France.&nbsp;Ces lobes &eacute;troits portent &agrave; leur sommet des [popupdefinition id=3156]cils[/popupdefinition] clairs &agrave; extr&eacute;mit&eacute; fonc&eacute;e, se terminant&nbsp;par une courbure abritant une sorte de capuchon tapiss&eacute; de soralies. Ces derni&egrave;res assurent la [popupdefinition id=13057]reproduction v&eacute;g&eacute;tative[/popupdefinition] de ce lichen.&nbsp;Le thalle peut &eacute;galement porter des apoth&eacute;cies d'un gris noir&acirc;tre. &copy; [popupbiographie id=1297]Yannick Agnan[/popupbiographie] - Tous droits r&eacute;serv&eacute;s</div><p>&nbsp;</p>

Physcia adscendens

En botanique, la reproduction végétative traduit un mode de reproduction asexuée. On le retrouve par exemple dans la bouture. Ce mode de reproduction engendre un végétal sans faire intervenir de gamètes. Une partie de la plante se détache et s'enracine. La bouture, le nouveau plant, est exactement identique à la plante mère : il s'agit d'un clone. La reproduction asexuée est assurée par certains organes, comme le rhizome, le tubercule, le bulbe ou le stolon.Principes et mécanismes de la reproduction végétativeLa reproduction végétative, ou clonale, permet à une plante de se propager horizontalement à partir de ses parties existantes plutôt que par la production de graines. Ce mécanisme est notamment prisé pour sa capacité à maintenir les traits génétiques favorables au sein d'une espèce ou d'une variété cultivée.Modes de reproduction végétativeCette forme de reproduction peut s'effectuer de manière naturelle ou artificielle. Naturellement, les plantes peuvent se reproduire végétativement par divers moyens :
 
Fragments de racines: Certaines espèces peuvent développer de nouveaux individus à partir de morceaux de racines.
 
Bulbes: Structures souterraines constituées de feuilles modifiées qui emmagasinent les nutriments.
 
Stolons: Tiges horizontales qui poussent à la surface du sol ou juste en dessous et qui peuvent former de nouvelles plantes aux nœuds.
Artificiellement, les horticulteurs utilisent des techniques comme la bouturage, la marcottage, ou la division des racines pour propager leurs plantes de manière contrôlée.Variations génétiques et avantagesContrairement à la reproduction sexuée, la reproduction végétative ne conduit pas à la variation génétique chez la progéniture, car elle est génétiquement identique à la plante mère. Ce phénomène favorise la stabilité des caractéristiques désirées mais peut aussi augmenter la vulnérabilité aux maladies si toutes les plantes dans une région sont génétiquement identiques.Ce mode de reproduction offre plusieurs avantages, notamment la rapidité et l'efficacité de la propagation, la conservation des caractéristiques génétiques spécifiques et la production de plantes à des coûts relativement bas. Elle est particulièrement utile dans la multiplication des plantes qui produisent difficilement des graines viables ou dont les graines ont un taux de germination très bas.Applications agricoles de la reproduction végétativeEn agriculture, la reproduction végétative est utilisée pour cultiver des espèces telles que les pommes de terre, les bananes et de nombreux arbres fruitiers. Elle permet aux agriculteurs de garantir que les produits récoltés possèdent les qualités exactes que les consommateurs attendent, comme la taille, la couleur et le goût des fruits.Impact sur la biodiversité et les enjeux écologiquesBien que bénéfique sous de nombreux aspects, la reproduction végétative a aussi des impacts sur la biodiversité. La diminution de la diversité génétique peut rendre les cultures plus susceptibles aux épidémies de maladies, ce qui est un défi majeur pour les agronomes et les biologistes du monde entier.Il est crucial de combiner judicieusement reproduction végétative et méthodes de reproduction sexuée pour maintenir la diversité génétique des plantes tout en optimisant les bénéfices agricoles.En résumé, la reproduction végétative joue un rôle crucial dans la propagation des plantes, offrant des avantages significatifs en termes de conservation des traits génétiques, tout en posant certains défis liés à la biodiversité et la santé des écosystèmes.

Reproduction végétative

Le ciment est une matière pulvérulente, à base de silicate et d'aluminate de chaux, obtenue par cuisson, en proportions variables selon les matières premières utilisées :
silicate tricalcique, ou C3S (3 CaO, SiO2),silicate bicalcique, ou C2S (2 CaO, SiO2),aluminate tricalcique, ou C3A (3 CaO,Al2O3),aluminoferrite tricalcique, ou C4AF (4 CaO, Al2O3, Fe3O3).
Les matières premières essentielles sont la roche calcaire et l'argile. Elles sont broyées et éventuellement additionnées de produits secondaires. Le mélange obtenu s'appelle le cru et est composé d'environ 80 % de calcaire et d'environ 20 % d'argile.
Caractéristiques et différentes formes du ciment
Cette matière forme, avec l'eau ou une solution saline, une pâte plastique liante. Après avoir durci dans l'air ou dans l'eau, cette pâte conserve sa résistance et sa stabilité. Sous forme de poudre mélangée à l'eau, le ciment permet d'agréger du sable fin pour produire du mortier, des granulats et du béton. Le mot recouvre plusieurs matériaux comme le plâtre, la chaux, la pouzzolane, le ciment prompt, le ciment Portland et le ciment de romain.
La fabrication du ciment
Sa fabrication passe par sept étapes : l'extraction des matières premières, leur homogénéisation, les méthodes de fabrication par voie humide ou sèche, le séchage, le broyage, la cuisson et le refroidissement. Pour la construction d'une maison, on peut choisir d'utiliser les parpaings de ciment qu'on appelle aussi blocs de béton. La France est leader mondial de l'industrie cimentière.
Dans le procédé dit à voie sèche, le plus courant aujourd'hui, le cru est préchauffé (et donc séché) dans un précalcinateur. Il est ensuite introduit dans un four cylindrique et tournant, aujourd'hui toujours horizontal (légèrement incliné). Leur longueur varie de 30 à 110 mètres. Un brûleur chauffe l'intérieur du four entre 1.400 et 1.500 °C.
La matière extraite du four s'appelle le clinker et est formée de blocs solides ressemblant à de la lave. Ce clinker est broyé et on ajoute au moins du sulfate de calcium, sous forme de gypse ou d'anhydrite, à raison de 3 à 5 %. Le résultat est le ciment. Cette formule classique est celle du ciment dit Portland. Champ lexical : liant hydraulique | ciment Portland

Ciment

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Lichens

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Les lichens, marqueurs de la pollution

Environnement

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Pollution de l'air

lien entre fragmentation des écosystèmes et biodiversité spécifique

les consequences de la science sur l'environnement

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Les champignons, ou plus justement les mycètes, regroupent de nombreuses espèces, formant ensemble l’un des cinq règnes du vivant. Bien que longtemps considérés comme des algues, et donc des plantes, ils se distinguent du règne végétal par de nombreuses caractéristiques, notamment par l’absence de chloroplastes, faisant d’eux des êtres hétérotrophes pour le carbone. D’après la classification phylogénétique, ils sont plus proches des animaux, formant avec eux l’essentiel du super-règne des opistochontes. Tous dérivent en effet d’un ancêtre eucaryote aquatique capable de se mouvoir à l’aide d’un flagelle.
Caractéristiques des champignons
Les mycètes présentent une grande diversité, certains étant unicellulaires (les levures) tandis que la plupart sont pluricellulaires. Tous sont eucaryotes et hétérotrophes, se nourrissant par nécrotrophie (matière organique inerte), biotrophie (parasitisme, comme les mycoses), ou symbiose (comme les lichens). Ils synthétisent des molécules qui ne sont pas retrouvées ailleurs dans le domaine du vivant. Enfin, ils se reproduisent par l’intermédiaire de spores non flagellées (voire uniflagellées), contenues dans des structures spéciales appelées sporophores. Chez les eumycètes, les champignons qui peuvent être cueillis, ce sont les sporophores (formés du pied et du chapeau) qui sont apparents et récoltés.
Classification des champignons
Le règne des mycètes se divise en quatre grands taxons, aux caractéristiques propres :
 les ascomycètes, produisent des spores regroupées en général par huit et contenues dans un sac, appelé asque, duquel elles sont projetées à maturité ; les basidiomycètes, dont les spores non flagellées se développent à l’extrémité des basides, cellules spécialisées, avant dispersion par le vent ; les chytridiomycètes, seuls champignons à posséder encore des spores uniflagellées, critère qui permet de les considérer comme des mycètes primitifs ; les gloméromycètes. 
Les oomycètes et les myxomycètes, autrefois rangés dans le règne fongique, ont depuis été exclus et rangés dans d’autres taxons.Champ lexical : mycète | fungi

Champignon

Les algues sont des organismes capables de pratiquer la photosynthèse et vivant majoritairement dans un milieu aquatique (marin ou dulcicole), ce sont donc des végétaux. Elles sont dépourvues de tige, de racine, de feuille ou de fleur.
Description des algues
Des milliers d’espèces d'algues sont unicellulaires et de tailles microscopiques, elles constituent le phytoplancton. Elles sont à la base des réseaux trophiques aquatiques, i.e. des chaînes alimentaires. D’autres espèces multicellulaires peuvent atteindre des tailles impressionnantes. La kelp géante possède par exemple des thalles (des « feuilles ») pouvant atteindre 45 mètres de long.
Classification des algues
Il s’agit d’un groupe polyphylétique incluant des organismes procaryotes (les cyanobactéries) et eucaryotes. Ces derniers sont répartis en plusieurs taxons dont les plus importants sont :
les algues bleues ;les algues brunes ;les algues rouges ;les algues verte. 
De nombreuses espèces sont comestibles pour l’Homme ou les animaux. Elles servent également d’engrais dans les régions littorales où elles sont récoltées sur les plages. Plusieurs projets essaient d’exploiter les algues pour la production de biocarburant. Certaines algues sont devenues invasives, comme la Caulerpa taxifolia.

Algue

Le biomonitoring, ou biosurveillance, est la détection de polluants dans un milieu au travers de leurs effets sur les organismes et sur les écosystèmes. 
Cette technique indirecte d’évaluation de la pollution, et donc de la qualité d’un milieu, repose sur la notion résumée par Tingey : « Il n'y a pas de meilleur indicateur de l'état d'une espèce ou d'un système, qu'une espèce ou un système lui-même ».
Principe du biomonitoring
La biosurveillance repose donc sur l’utilisation de bio-indicateurs (lichens, mousses, insectes, etc.) qui fournissent des informations sur l’état de leur milieu ainsi que sur l’incidence de la cumulation des polluants sur les organismes et écosystèmes. Ces organismes d’étude permettent aussi de contrôler leur répartition spatio-temporelle.
Techniques de biomonitoring
Les techniques de surveillance biologique emploient des méthodes passives, basées sur des populations d’organismes indigènes, et des méthodes actives, qui ont recours à des transplants d’organismes depuis un site de référence. 
Par exemple, l’observation des dépôts de métaux lourds d’origine aérienne dans les mousses d’une ville fait partie des méthodes passives, à l’inverse de l’observation des effets biochimiques et physiologiques de l’ozone troposphérique sur des génotypes sensibles de trèfle blanc importés depuis une région sans ozone.
Le biomonitoring pour l'Homme
Le biomonitoring s’applique aussi à l’espèce humaine. Dans ce cas, l’étude des métabolites contenus dans le sang, l’urine ou encore les cheveux, peut déterminer le degré d'exposition à certains contaminants comme le plomb ou le lindane. Champ lexical : biosurveillance | surveillance biologique

Biomonitoring

Le terme « air » désigne le fluide gazeux parfait, incolore, inodore et invisible qui constitue l’atmosphère terrestre. On l'associe plus généralement à la troposphère, la couche de l’atmosphère de la Terre la plus proche de la surface du globe. En contact direct avec cette dernière, l’air est donc sensible à l’évaporation des océans, à la photosynthèse ou encore aux activités humaines.
Composition de l'air
L’air est un mélange de différents corps purs dans leur état gazeux. La composition de l'air sec est la suivante :
78 % de diazote ;21 % de dioxygène ;environ 1 % d’argon ;des traces de néon, de krypton, de xénon et d’hélium.
Ces proportions — même si la concentration de l’air diminue avec l’altitude — sont identiques quel que soit le lieu et jusqu’à une altitude de 100 kilomètres. Au-delà, il n’y a pas quasiment plus d’air.
L’air contient également de la vapeur d’eau dans des concentrations qui peuvent beaucoup varier, aussi bien dans le temps que dans l’espace. Ainsi, dans un air froid, le volume de vapeur d’eau dans l’air ne dépasse pas les 0,6 %. En revanche, dans un air chaud, il peut monter jusqu’à plus de 4 %.
Certaines activités humaines affectent la composition de l’atmosphère. En France, la qualité de l’air est désormais surveillée. En fonction des prévisions météo, des pics de pollution peuvent être prévus sur des zones assez précises. © SD-Pictures, Pixabay, DP
Pollution de l’air
La pollution atmosphérique est susceptible de modifier la composition de l’air et d’y ajouter ou d’y supprimer de l’ozone, du méthane ou encore du dioxyde de carbone, par exemple. Les proportions de ces gaz aussi peuvent varier avec l’altitude. Ainsi, l’ozone se concentre entre 20 et 40 kilomètres d’altitude, dans la couche d’ozone.
L’air véhicule aussi des aérosols, des particules solides ou liquides formées par des phénomènes naturels — comme les éruptions volcaniques ou la dispersion du pollen — ou par des activités industrielles. La concentration des aérosols est bien sûr variable.
Mouvements de l’air
L’air est aminé de mouvements incessants provoqués par des différences de température et de pression. En effet, la température de l’air, par exemple, décroît, dans la troposphère, de quelque 6 °C par kilomètre d’altitude. De quoi créer des mouvements de convection rapide. Les mouvements de l’air se ressentent notamment lorsque le vent souffle.

Coupe transversale d'un thalle

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