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    • 1. Comment la modification de structure de la chromatinechromatine va t'elle activer l'ATM ? Est-ce une reconnaissance directe ou indirecte ? Il existe quelques données permettant de penser que l'activation de l'ATM par les cassures double brindouble brin est indirecte. L'ATM est capable de phosphorylerphosphoryler la p53p53 en dehors des régions endommagées, suggérant qu'un signal a été transmis aux protéinesprotéines ATM dans ces régions.
    • 2. Le mécanisme de reconnaissance des protéines cibles par l'ATM demeure toujours inconnu. La p53 est phosphorylée par l'ATM apparemment sans l'aide d'autres protéines, suggérant une reconnaissance directe entre l'ATM et la p53. Cependant, la majorité des cibles sont uniquement reconnues au niveau des cassures double brin par l'ATM activée. Il est donc probable que des protéines adaptatrices permettent l'interaction entre ces protéines et l'ATM.
    • 3. Comment l'état inactif du système est-il rétabli lorsque l'ADNADN est réparé ? Les ATM activées sont elles dégradées ? Ou le phosphate responsable de l'activation de la protéine est-il retiré de l'ATM (déphosphorylation), permettant la formation du dimère et le retour a un état inactif de l'ATM?
    • 4. Quelle est la spécificité des changements de la chromatine lors de cassures double brin? Les modifications de la structure de la chromatine sont fréquentes lors de l'expression des gènesgènes et durant le cycle de division cellulaire lors de la réplicationréplication de l'ADN et pourtant l'ATM semble ne pas réagir à de tels changements. Y a-t-il quelque chose d'unique dans les changements entraînés par la cassure double brin ? Ou y aurait-il plutôt un effet de seuil : le changement de la structure de l'ADN lors de cassures ou d'une mauvaise réplication de celui-ci serait supérieur à celui rencontré habituellement ?

    Chez la levurelevure, on connaît en effet un seuil pour l'activation du système de réponse à l'atteinte de l'ADN pendant la synthèse de celui-ci. Mais d'après les découvertes de Bakkenist et Kastan un niveau très faible de cassure double brin suffit à activer l'ATM, et si un tel seuil existe, il est susceptible d'intervenir plus tard dans le processus.