Pour établir les liens de parenté entre espèces (phylogénie) les chercheurs peuvent comparer les caractères anatomiques ou faire des analyses moléculaires, ADN par exemple. On obtient alors des clades qui montrent les liens de parenté. Mais, il peut y avoir des conflits entre les méthodes…
Les relations de parenté des mammifères sont assez bien établies, et les acquis récents ont conduit à proposer des relation inter- et intra-groupes assez cohérentes. C'est le cas des carnivores, des primates ou encore de celle des Paenongulés, un clade qui, sur la base de données moléculaires et paléontologiques regroupe les Proboscidiens (éléphants), les Siréniens (dugongs et lamantins), et les Hyracoides (damans).
Cependant, la phylogénie des Mammifères reste un domaine dans lequel plusieurs incertitudes persistent. Par exemple, le groupe de Mammifères qui a donné naissance aux Primates reste encore mystérieux… Les difficultés pour établir des relations entre différents groupes de Mammifères reposent sur des conflits entre données moléculaires et fossiles. Les Afrothères sont un exemple typique.

Classification des Afrothériens
Ce clade, basé sur les études moléculaires, regroupe les Paenongulés, les Chrysochlores (taupe dorée du Cap), les Tenrecs, les Macroscèles (éléphantules) et les Oryctéropes. Ce modèle implique, que les Mammifères endémiques d'Afrique aient évolué de manière insulaire depuis le Crétacé. Ceci est en conflit avec la paléontologie qui prouve l'existence de nombreux échanges durant cette période. De même, un autre désaccord entre les deux approches moléculaire et paléontologique concerne la biogéographie et l'âge de divergence pour les Mammifères. L'ensemble des gènes étudiés montre un âge de divergence très ancien pour les Mammifères, ce qui ne correspond pas à l'image donnée par la paléontologie. La radiation d'au moins 5 groupes de Mammifères se serait prétendument déroulée il y a environ 100 millions d'années, ceci est en désaccord avec la paléontologie qui démontre que la radiation des Mammifères s'est effectuée en un temps très court, à partir d'une lignée commune, au cours de la fin du Crétacé (il y a environ -65 à -55 Ma).
Les fossiles du Fayum en Egypte indiquent qu'il y a 36 Ma les hyrax étaient le groupe le plus important d'ongulés de taille moyenne broutant en Afrique. Ils avaient la taille des tapirs actuels environ 1 m au garrot et 220 à 300 kilos et ils ont proliféré jusqu'au Miocène. A l'époque de la radiation des Bovidés ( antilopes et chèvres…), la diversité des hyrax a fortement diminué et ils se sont retrouvés dans des milieux rocheux (les seuls à ne pas être envahis par les bovidés). Les hyrax contemporains ont gardé quelques structures archaïques, notamment leur mécanisme d'alimentation, leur homéothermie imparfaite et leurs courtes jambes !
Taxonomie des Hyracoidés (Afrothériens)
Les hyrax sont membres de l'ordre des Hyracoïdés, famille des Procaviidés. Trois genres existent actuellement avec 5 espèces semblables superficiellement ( taille et apparence). Quelques auteurs considèrent le Daman des rochers Procavia capensis comme la seule espèce qui comprendrait 17 sous-espèces mais les analyses d'ADN indiquent que 2 espèces existent en Afrique du Sud… Bref nous allons adopter la classification suivante basée sur le livre de référence en Afrique du Sud : The mammals of the Southern African Subregion de J.D. Skinner, Université de Prétoria, 1990 soit :

Jeune Daman des rochers, Procavia capensis, Namibie
© Christian König
Reproduction et utilisation interdites
Le genre Heterohyrax comprend H.brucei ou yellow-spotted rock dassie en anglais avec des sous-espèces pour l'Ethiopie et le Transwaal donc distribué seulement en Afrique de l'Est.

Heterohyrax sp.
Le troisième genre est Dendrohyrax , avec D. arboreus entre autres sous-espèces et une distribution beaucoup plus restreinte en Afrique de l'Est. Ce sont les plus menacés.

Dendrohyrax sp.
Remarque : toutes les autres photos de daman de ce dossier sont des images de Procavia capensis.
Quelques indications sur les plus proches parents des damans :

Tenrec ecodatus
© Garbutt, N. 1999, Mammals of Madagascar, Yale University Press
Reproduction et utilisation interdites

Dessin de : Chrysochloris sp.

Brachyrhyncus sp.
Elephantulus brachyrhynchus
© Richard Yarnell
Reproduction et utilisation interdites

Petrodomus tetradactylus

Macroscelide sp.
© Galen Rathbun
Reproduction et utilisation interdites

Oryctérope

Eléphant d'Afrique

Lamantin
Le terme de vache marine est également utilisé populairement pour désigner le dugong et le lamantin; ceux-ci atteignent 2,4 à 4,5 m de long et ressemblent superficiellement au morse.

Dugong
© Alexis Rosenfeld
Reproduction et utilisation interdites
Le dugong a une nageoire dorsale à deux lobes; celle du lamantin est large et arrondie. 2 familles, 4 espèces. Ex : dugong et lamantin.