En phylogénie, un caractère apomorphe (ou dérivé) est un caractère qui est différent de l'état ancestral.
Au cours de l'évolution, les êtres vivants subissent des modifications génotypiques (mutations, recombinaisons...) qui mènent à des changements du phénotype. Lorsque, chez un individu, un caractère est différent de celui de son ancêtre, on parle d'apomorphie.
Exemple d'apomorphie
Par exemple, la fusion des clavicules chez les oiseaux est un caractère dérivé par rapport au caractère ancestral (clavicule non fusionnée chez les ancêtres des oiseaux).
