Microbiome

Ensemble des génomes des bactéries colonisant l'organisme d'un animal. On les considère collectivement pour une raison essentiellement pratique. Plutôt que de séquencer successivement les génomes de toutes les espèces bactériennes, on utilise les méthodes de la métagénomique, applicable à un écosystème complet.

Les bactéries qui vivent en commensalisme avec le corps des animaux y jouent des rôles très importants, notamment pour la digestion et la défense contre les organismes pathogènes.

On estime que les bactéries hébergées par le corps humain sont environ dix fois plus nombreuses que ses propres cellules. L'ensemble de leurs populations forme un écosystème dont on sait peu de choses et qui fait aujourd'hui l'objet d'études.